转化医学研究院是中国药科大学的二级研究机构，于2024年2月成立，是由中国药科大学与南京市鼓楼区人民政府，基于《南京市鼓楼区人民政府与中国药科大学关于深化校地融合战略合作协议》，本着“深化合作、优势互补、携手发展、互利共赢”的原则，共同建设。

目标是以转化院为载体，主要探索“以临床价值为导向的生命健康科学研究”，构建服务药物研发全链条的创新研究平台，推进临床与基础研究深度融合，共同推进创新药物研究，加速科技成果转化，孵育一批具有自主知识产权和国内外领先的创新药物，遴选具有良好成药性前景的创新药物项目，孵化一批创新型企业。通过研究院的专业技术平台、领军团队、核心技术、高端智库等全链条服务优势，吸引国内外大型制药企业，生命健康产业关联企业和社会金融资本在鼓楼区集聚，合力推动我国生命健康产业新质生产力的发展。